根据分子蒸馏实验的原理可知，分子蒸馏实验主要依靠轻质分子与重质分子之间的分子平均自由程的差异进行分离，同时分离过程中逸出的待分离轻质分子极易于被冷却获得轻质循分，因而分子蒸馏技术具有以下几项基本特点:

　　远离化合物沸点的低温蒸馏常规蒸馏技术主要依靠化合物之间的沸点的不同来进行分离，因而要实现高效分离就使得待分离化合物处于沸腾状态，分子蒸馏实验因而常规的蒸馏技术的分离过程需要较高的温度。分子蒸馏实验技术依靠化合物的分子运动平均自由程的差异进行分离，高真空度的蒸馏过程既能降低化合物的满点也可以进一步增大化合物之间平均自由程的差异，因而该蒸馏过程可以在低温度下进行高效蒸馏。
　　超低压下的蒸馏理论上的分子蒸馏实验过程发生在0.01pa值0.1pa之间，超低的蒸馏压力可以增大化合物的分子运动平均自由程，进而扩大化合物间平均自由程的差异，实现高效分离。传统的蒸馏技术多为釜式蒸馏，待分离的化合物首先在沸点下气化变成气体，气态的化合物在真空泵的作用下被整体抽出，流经冷凝器的时候才可以得到冷凝。冷凝器与蒸发面之问过长的距离，使得该段
　　分子蒸馏实验距离间充满了气态化合物，因而很难降低蒸发液面处的压力。对于分子蒸馏技术，由于冷凝器与蒸发表面布置得十分紧密，待分离的化合物一旦挥发逸出，便立即被冷凝，因而冷凝器与蒸发器表面之间的气态化合物分压很低，可以实验超低压下的化合物分离。
　　快速与高效分离分子蒸馏实验过程中待分离化合物从分离器主体的上部流入，从下部流出。在蒸发器表面上，待分离化合物会在成膜部件的作用下形成2mm左右厚度的液膜，液膜状的蒸馏有利于待分离化合物的高效逸出。同时分子蒸馏实验过程中，冷凝面与蒸发表面的近距离布置，使得待分离化合物一旦逸出就能够得到迅速的冷凝，因而减少了热敏性待分离化合物在高温下的停留时间，有利于保持化合物的特性。总体而言，分子蒸馏技术既能够减少待分离化合物在加热表面的停留时间，也可以缩短挥发份从逸出至冷凝之间的高温气态停留时间。