分子精馏设备是一种在高真空下操作的精馏方法，蒸气分子的平均自由程大于蒸发表面与冷凝表面之间的距离，从而可利用料液中各组分蒸发速率的差异，对液体混合物进行分离。
在一些温度下，压力越低，气体分子的平均自由程越大。当蒸发空间的压力很低，且使冷凝表面靠近蒸发表面，其间的垂直距离小于气体分子的平均自由程时，从蒸发表面汽化的蒸气分子，可以不与其他分子碰撞，直接到达冷凝表面而冷凝。
它对应的设备是短程分子精馏仪，它的蒸发效率非常高，可以减少保留时间，具有小的时间延迟;系统由高硼硅玻璃3.3、316L不锈钢、PTFE组成，因此具有具有很好的防腐蚀能力;主体由高硼硅玻璃3.3制成，可很好的观察到整个工艺的运转过程。
分子精馏设备的内置冷凝器与主蒸发器为一体设计，一体生产，减少安装难度，减少了连接接口，增加了真空密封性，减少因接口密封漏气可能性，连接接口密封采用包四氟O型圈线性密封，马蹄型夹紧固，方便安装、拆卸，均固定可移动框架内，占地面积小，方便移动。
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